醫院高效過濾器的類型包括有隔板高效空氣過濾器和無隔板高效空氣過濾器。按結構主要分為H13高效隔板過濾器、H14無隔板高效過濾器和組合高效過濾器。

無隔板醫院高效過濾器包括組合式高效過濾器、HV組合式高效過濾器、液槽無隔板高效過濾器、超高效過濾器、亞高效過濾器、超低阻無隔板高效過濾器、刀架式無隔板高效過濾器等。無隔板主要以熱溶膠為濾芯，便于機械化生產。此外，它具有體積小、重量輕、安裝方便、效率穩定、風速均勻等優點。目前，潔凈廠房所需的大量過濾器大多采用無隔板結構。

有隔板高效過濾器包括有隔板高效過濾器、耐高溫高效過濾器、耐高濕高效過濾器等。高效有隔板多采用鋁箔、優質牛皮紙制成折疊式濾芯分隔物，熱滾壓成型或采用膠版紙作為隔板，形成空氣通道。根據一帆過濾行業多年的經驗，當溫度和濕度發生變化時，紙隔板可能會散發出大顆粒，導致潔凈廠房潔凈度測試不合格。因此，建議新老客戶多使用鋁隔板高效空氣過濾器。

醫院高效過濾器的濾料主要有化纖無紡布、玻璃纖維等，有些廠家有棉纖與化纖的混合濾料、金屬網等，目前國外有些廠家采用帶靜電的聚四氟乙烯纖維（駐極體）制造高效率過濾器，俗稱PTFE。